一、科學合理原則

　　傳染性和致病性再強的病原微生物，只要它不和人體接觸，感染就不會發生，把病原體圍場在一定空間范圍內，使之避免暴露在開放的環境中，操作者間接對其操作(如手套、機械手等)，在圍場內接觸的空氣和水體經過處理后排放。在實驗室內使用的生物安全柜。在圍場(包括安全柜和實驗室)內接觸的空氣均視為污染的有害物質，把實驗室內空氣經過HEPA濾器過濾后或其他凈化后排放，以保護環境。

　　二、安全原則

　　安全是建設實驗室的直接目的，建造中一切不利安全的設計都應取締，一切與生物安全有沖突的參數設計都應服從安全的要求。例如：凈化要求要服從安全，使用方便服從安全，節約服從安全，人性化服從安全。

　　三、設計原則

　　修造實驗室前做好對擬從事的病原微生物和研究內容的危險評估，一定要有科學、合理的總體構思和概念設計，在此基礎上要根據操作過程的梗概進行平面布局工藝設計，然后再進行空調通風和電控等的具體設計。

　　四、管理原則

　　一定要按照國務院發布的《病原微生物實驗室生物安全管理條例》進行管理。這個條例對致病微生物的管理原則是：病原微生物是分類管理，實驗室是分級管理。

　　五、遠離病原原則

　　修建實驗室是為了研究致病微生物和高致病微生物，必要的實驗必須在實驗室內進行。但是，非必要的時候盡可能少接觸病原體或少進實驗室。例如，能在半污染區做的不進污染區;能在清潔區做的不進半污染區;進實驗室2人能完成不用3人;無關人員不進實驗室。使用實驗室后應及時凈化處理和滅菌，不要存留污物。不用的需要保存的菌(毒)液應送到保藏機構保存。

　　六、預防原則

　　實驗室要使用經過生物和物理的檢測并且合格的安全柜、排風過濾器和高壓蒸汽滅菌器，確保達到零泄漏，通過對實驗過程的安全監測，發現問題要及時采取預防和改進措施。有實驗室感染的征兆，要及時采取隔離治療措施，以防止出現二代病例。

　　七、使用原則

　　實驗室建設在保證安全的前提下，應考慮工作過程中活動合理方便的問題。所以在制定方案時應該征求使用人的意見。

　　八、節約原則

　　在保證安全的前提下，應提倡節約的原則。保證安全的尺度是國標(GBl9489—2004)。安全性能要可靠，一切都要嚴格，講究實質，功能齊全，合乎要求，但不求豪華。